Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX27Q96L92 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX27Q96L92 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX27Q96L92 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms