Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL4Q96JB6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL4Q96JB6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXL4Q96JB6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms