Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIC2Q96JB3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIC2Q96JB3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIC2Q96JB3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIC2Q96JB3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIC2Q96JB3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIC2Q96JB3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIC2Q96JB3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms