Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BORCS6Q96GS4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms