Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDXPQ96GD0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDXPQ96GD0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDXPQ96GD0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms