Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL48Q96GC5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms