Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN17Q96FV3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN17Q96FV3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms