Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PGBD4Q96DM1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD4Q96DM1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms