Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RHBDF1Q96CC6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms