Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCCAG3Q96C92 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms