Protein–RNA interactions for Protein: Q96B45

BORCS7, BLOC-1-related complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7Q96B45 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BORCS7Q96B45 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BORCS7Q96B45 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms