Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM143Q96AN5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms