Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX21Q969T3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX21Q969T3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms