Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS3Q969F9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS3Q969F9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms