Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAMP4Q969E2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP4Q969E2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms