Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHMTQ93088 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms