Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2A3Q93084 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2A3Q93084 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms