Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL5Q93034 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL5Q93034 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms