Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNPO1Q92973 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNPO1Q92973 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms