Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NEO1Q92859 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEO1Q92859 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEO1Q92859 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms