Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF4BQ92750 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF4BQ92750 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms