Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABGGTAQ92696 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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