Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF3Q92576 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms