Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNKSR2Q8WXI2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNKSR2Q8WXI2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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