Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKIN2Q8WXE0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms