Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC4Q8WW27 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC4Q8WW27 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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