Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D1Q8WV19 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms