Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DCAF4Q8WV16 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DCAF4Q8WV16 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms