Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX29Q8TEQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX29Q8TEQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms