Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANK1Q8TE04 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANK1Q8TE04 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANK1Q8TE04 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANK1Q8TE04 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANK1Q8TE04 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANK1Q8TE04 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANK1Q8TE04 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANK1Q8TE04 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANK1Q8TE04 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PANK1Q8TE04 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms