Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTRT1Q8TDG2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT1Q8TDG2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms