Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGARPQ8TDB4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms