Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3IL1Q8TBN0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms