Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 PAXBP1-204ENST00000443785 2920 ntTSL 1 (best)18.02■□□□□ 0.474e-9■■■■■ 48.4
PUM2Q8TB72 PAXBP1-209ENST00000497873 2277 ntTSL 28.06□□□□□ -1.124e-9■■■■■ 48.4
PUM2Q8TB72 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 48.4
PUM2Q8TB72 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.394e-10■■■■■ 48.3
PUM2Q8TB72 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.842e-64■■■■■ 48.3
PUM2Q8TB72 ATP6AP1-209ENST00000491569 2079 ntTSL 219.63■□□□□ 0.732e-64■■■■■ 48.3
PUM2Q8TB72 ATP6AP1-207ENST00000455205 4515 ntTSL 214.59□□□□□ -0.072e-64■■■■■ 48.3
PUM2Q8TB72 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-64■■■■■ 48.3
PUM2Q8TB72 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 48.2
PUM2Q8TB72 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.43e-6■■■■■ 48.2
PUM2Q8TB72 RABL3-204ENST00000473654 2370 ntTSL 510.18□□□□□ -0.782e-15■■■■■ 48.2
PUM2Q8TB72 RABL3-202ENST00000465022 839 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-15■■■■■ 48.2
PUM2Q8TB72 RABL3-205ENST00000481015 833 ntTSL 56.48□□□□□ -1.372e-15■■■■■ 48.2
PUM2Q8TB72 RABL3-207ENST00000485161 1715 ntTSL 56.42□□□□□ -1.382e-15■■■■■ 48.2
PUM2Q8TB72 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.522e-15■■■■■ 48.2
PUM2Q8TB72 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 48.2
PUM2Q8TB72 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.391e-9■■■■■ 48.1
PUM2Q8TB72 CEP135-201ENST00000257287 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 48.1
PUM2Q8TB72 CEP135-203ENST00000506202 5129 ntTSL 1 (best)7.94□□□□□ -1.142e-8■■■■■ 48.1
PUM2Q8TB72 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.353e-7■■■■■ 48.1
PUM2Q8TB72 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.463e-7■■■■■ 48.1
PUM2Q8TB72 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.141e-13■■■■■ 48.1
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PUM2Q8TB72 NOL8-228ENST00000545444 2090 ntTSL 56.74□□□□□ -1.332e-17■■■■■ 48.1
PUM2Q8TB72 NOL8-210ENST00000463593 1238 ntTSL 56.39□□□□□ -1.392e-17■■■■■ 48.1
PUM2Q8TB72 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.42e-17■■■■■ 48.1
PUM2Q8TB72 NOL8-217ENST00000536593 4053 ntTSL 1 (best)4.41□□□□□ -1.72e-17■■■■■ 48.1
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PUM2Q8TB72 WDHD1-205ENST00000567693 2348 ntTSL 24.27□□□□□ -1.735e-9■■■■■ 48
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PUM2Q8TB72 MED17-206ENST00000529626 2275 ntTSL 1 (best)3.87□□□□□ -1.795e-7■■■■■ 47.9
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PUM2Q8TB72 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 47.9
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PUM2Q8TB72 GDF11-202ENST00000546799 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.33■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 47.9
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PUM2Q8TB72 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 47.9
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PUM2Q8TB72 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 BRPF1-208ENST00000497565 689 ntTSL 311.88□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 PEX16-206ENST00000527371 362 ntTSL 311.65□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 KBTBD6-201ENST00000379485 5178 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 PIK3R1-216ENST00000523872 2473 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 AL359873.1-201ENST00000447908 764 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 PIK3R1-202ENST00000336483 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 MAP3K8-202ENST00000375321 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 CSTF3-208ENST00000528865 592 ntTSL 58.08□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 E2F5-201ENST00000256117 5042 ntTSL 57.51□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 PPCS-205ENST00000469615 778 ntTSL 27.38□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.249e-14■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 PPCS-204ENST00000372562 966 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 E2F5-205ENST00000518234 674 ntTSL 57.1□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 PPCS-208ENST00000482168 688 ntTSL 26.09□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 E2F5-206ENST00000520225 604 ntTSL 34.94□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 47.9
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PUM2Q8TB72 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 54.62□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 47.9
PUM2Q8TB72 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.034e-14■■■■■ 47.8
PUM2Q8TB72 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 47.8
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