Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4L1Q8NHW4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4L1Q8NHW4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms