Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNL1Q8NG31 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms