Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1CQ8NER5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms