Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM3Q8NE01 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms