Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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