Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM35BQ8NCS4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms