Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COLGALT1Q8NBJ5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COLGALT1Q8NBJ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms