Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AVL9Q8NBF6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AVL9Q8NBF6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AVL9Q8NBF6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AVL9Q8NBF6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AVL9Q8NBF6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AVL9Q8NBF6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AVL9Q8NBF6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AVL9Q8NBF6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AVL9Q8NBF6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AVL9Q8NBF6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms