Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PNLDC1Q8NA58 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms