Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8N9G6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N9G6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N9G6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N9G6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N9G6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N9G6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N9G6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N9G6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N9G6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N9G6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N9G6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N9G6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N9G6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N9G6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8N9G6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8N9G6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8N9G6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8N9G6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N9G6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N9G6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N9G6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N9G6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N9G6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N9G6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N9G6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N9G6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N9G6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N9G6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8N9G6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8N9G6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8N9G6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8N9G6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8N9G6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8N9G6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8N9G6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N9G6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N9G6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N9G6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N9G6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N9G6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N9G6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N9G6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N9G6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N9G6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N9G6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N9G6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N9G6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N9G6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N9G6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N9G6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N9G6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N9G6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N9G6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N9G6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N9G6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N9G6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N9G6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N9G6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N9G6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N9G6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N9G6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N9G6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms