Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHCHD4Q8N4Q1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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