Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCL2Q8N4E4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms