Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPM1KQ8N3J5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPM1KQ8N3J5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms