Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBARPQ8N350 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBARPQ8N350 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms