Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP3Q8IZU3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP3Q8IZU3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms