Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D3Q8IZS8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA2D3Q8IZS8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms